אמוניפיקציה שלב במחזור החנקן בטבע, בו החנקן עובר מצורת אמין, שבה הוא קשור בתרכובות אורגניות (בחומצות אמינו למשל), לצורה המינרלית של אמון (NH4+) או אמוניה הזמינה לצמחים. תהליך זה הוא תוצאה של פעילות בקטריות ופטריות אירוביות (צורכות חמצן) המפרקות תרכובות אורגניות בקרקע.