שורש השורש הוא האיבר התת קרקעי של הצמח. הוא משמש לאחיזתו בקרקע ולקליטת מים ומינרלים. חלק השורש היונק באופן פעיל מים ומינרלים נקרא אזור היונקות שהן שלוחות תאי שורש נימיות עדינות ודקות דופן, הנמצאות קרוב לקצה השורש. אזור המעבר בין השורש לגבעול נקרא צוואר השורש. לשורש תכונה לצמוח בכיוון כוח הכובד אפילו אם הונח במהופך. תכונה זו נקראת גיאוטרופיזם חיובי. בדרך כלל מתפתח השורש מהשורשון של העובר אך במקרים מרובים צומחים שורשים מחלקי צמח אחרים כגון: מהגבעול או מהעלים (שורשים אדוונטיבים). סביבתם המיידית והקרובה של שורשי צמח מסוים מכונה בית השורשים.